百泉藥會起源于隋朝大業年間的衛源廟會。道光十五年《輝縣志》“四月八日，祭衛源神廟，四方貿易者皆到，南北藥材，亦聚十余日始散”。

明洪武八年(1375年)百泉藥會得到官府承認，每年農歷四月初八，各地藥材商賈匯聚百泉，坐地走販，成為當時全國最大的藥材交易場所。百泉藥會與河北安國、江西樟樹并稱全國三大藥材交流大會，其歷史和規模居三大藥會之首。百泉藥會又與安徽亳州、廣州清平、廣西玉林、成都荷花池、西安康復路、甘肅隴西、河南禹州、河北安國、江西樟樹的藥材市場并稱為“全國十大藥市”，有“春暖花開到百泉，不到百泉藥不全”之盛譽。

2008年6月7日，《百泉藥會》被國務院公布為國家級第一批非物質文化遺產擴展保護項目。

百泉藥會包括以下基本內容：

1.大會組織

百泉藥會自明洪武八年（1375年）形成之日起，在很長一個時期都處于有序進行，卻無組織之狀態。隨著貿易的興盛發展，清嘉慶初年，成立了“百泉藥王會”，由百泉村藥幫會首和棚下會首組成，是藥商們自發組織的服務于藥材交易活動的臨時組織機構。主要職責是解決棚口間、藥鋪間、藥攤間的糾葛，以及貨物的真偽、貨款的清算、會費的收取、商議大會有關事議、組織藥商祭祀藥王活動等。

清末民國時期出現了臨時商會。臨時商會是以政府官員為主、有關商會和組織為輔組成的臨時權力機構。其主要職責是制定商會章程，維護大會秩序，保障交易安全，指導整個大會的實施進程。1950年春，成立了百泉藥會委員會。百泉藥會委員會是百泉藥會的領導機構，由輝縣市人民政府有關領導和國家中醫藥管理局、中國藥材公司等上級主管部門與省市有關領導組成，處理大會一切事宜。

2.大會會期

據輝縣舊志載，明清時期，藥會的會期每年為10天左右。清末至民國時期，為一個月左右。1950年藥會恢復后，會期最短為18天，最長為37天（1954年）。1983年會期為10天，1993年以后，整個交易時間只有7天。1998年會期只有4天。

3.大會市場

明清至民國時期的各類貨物交易場地基本固定。東街為藥貨區，磨盤街為京貨區，南街為掛貨區，百泉中學一帶為農具區。1955年—1956年，大會交易改在百泉書院與“北小山”的一幢房子里進行。1957—1959年，交易場所遷至百泉中學內。1980年，大會交易場所固定在百泉賓館和共城賓館。1982年，全國藥界集資在共城賓館內建起9976平方米的藥貿大廈。1990年，建成百泉藥都，徹底結束了百泉藥會交易市場變換不定的歷史。此外，在百泉藥都交易市場周圍的藥都路、藥貿路、藥園路及藥貨街上，開辟了常年性的交易市場。

4.大會行幫

行幫有影響力的有：廣字號的山西太谷幫、陜西西安幫（華陰邦）、河南懷慶幫（河內幫）、河南彰德幫、河南禹州幫、河北安國幫、江西樟樹幫、安徽亳州幫、山東東阿幫、湖北江夏幫、四川成都幫、廣東清平幫、廣西玉林幫、甘肅隴西幫等。

5.大會經濟

民國十八年，交易總額達300萬元。1950年成交額36萬元，1959年達916萬元，1960—1963年交易額分別為534萬元、415萬元、686萬元、678萬元，1964年交易額高達1322萬元，1980年成交額達1.2億元，1981年成交額達2.8億元，1982年成交額達4.2億元，1988年成交額為13.5億元，1992年成交額為15億元，1993年成交額高達24億元，1994年以后呈連續下跌趨勢。

6.大會習俗

百泉藥會在長達600多年的歷史長河中，形成了獨特的習慣和風俗，具有鮮明的時代特征和濃厚的地域風情，大會習俗有藥王廟會、點放水鴨、祭拜藥王、避會等。另外，由于百泉藥會起源于衛源廟會，決定了它的特殊貿易習俗，即藥材交流與物資貿易同會異場。再者藥會上各種各樣的文藝宣傳和廣告宣傳令人目不暇接。

7.交易藥類

1983年上會的藥材交易品種現已達3710個，其中中藥材為820種，中成藥為1080種，西藥為1300多種，其它藥品（含滋補保健等）400多種，醫療器械111種。1997年參加交易的中藥材及中西成藥多達5萬多種，其中中藥材就有1020種。

8.文化活動

藥會期間，會場人山人海，萬家空巷，吸引了全國各地文藝團體到百泉演出，如吳橋馬戲、濮陽雜技等。各類民間技藝也齊聚于此，如吹糖人、捏泥玩等，五花八門，種類繁多，把藥會變作了民間文化的展示場所。

千百年來，全國各地的藥商們聚集于此，傳遞信息，互通有無，給人們帶來了健康和快樂，使百泉走向全國，帶動了當地的其它產業的迅速發展。百泉藥會作為中國藥材交易大會的“龍頭老大”，其百泉大會交易的走向，成為我國社會主義醫藥事業的晴雨表，對于挖掘中藥文化的發展、弘揚中國中醫事業有著不可替代的作用。