馮從吾十月罷歸,林居凡二十六年,“以學行其道”。他仿云浦講會,與王經軒、張舜典、蕭茂才諸君子講學于寶慶寺。“從游者日益眾,一時縉紳學士多執經問難,而農工商賈環視竊聽,有非寶慶禪寺所能容者,當道遂為辟今關中書院以聚眾講肄。”(馮從吾.馮恭定全書:卷十一)一時,“同志川至云集”,川、甘、豫、鄂等地學子紛紛負笈前來就讀,盛況空前,從學者多達五千余人。馮從吾亦聲名大震,被譽為“關西夫子”。為了提高講學效果,他擬出《關中士夫會約》十三條,約定會期及聚會的具體規定;并將云浦先生撰寫的《初學每日用功法》刻印出來,發給大家。馮從吾在《孟云浦教言跋》中寫道:“先生講學新安,而伊洛間庶幾復睹者二程之化。觀其示初學用功諸條,而先生之教之學,可窺一斑矣。頃者,先生寄示不佞,不佞受而讀之,欣然有當于心也。爰付梓人,用代韋弦之佩,并與同志者共焉。”
別后不到一年,云浦先生就辭世了。訃音一至,從吾泣涕橫流。他說:“嗚呼!痛哉!始余別先生于函關也,見其神王氣充,竊意必享期頤之算,詎意握手之日,即為永訣之秋也!余所為先生悲者,在吾道之運厄而斯文之會否。同志者方有興起之意,則今悵悵乎其無所倚,豈直從吾一人抱鐘期之痛于無已也哉!”他在《與楊晉庵都諫》的信中慨嘆道:“憶吾三人鼎足談學,曾幾何時,頓有離合存亡之感。叔龍乎,叔龍乎,九原不可作矣。”
汝上張維新,與云浦交好,肩從齒序,氣味相洽,歷三十余祀如一日。萬歷二十五年,張維新匍匐哭木前,向從燕邸,促席請益,云浦往矣,言猶泠泠耳根也。檢先生書簏,得其集。張維新以為“云浦上接孔門命脈,真得文成心印,假令后死表豎中外,道盛業隆,曷可涯涘,若藏舟于壑,惜哉!”于是以質關內馮從吾。馮孟夙稱莫逆,致其書曰:“云浦平生苦心,盡是矣。盍傳諸?”馮從吾乃約黃輝、逯中立、鄒元標、楊東明、鍾化民等昔時老友,及門人王以悟、崔儒秀、呂維祺、李緝敬、王鐸、屠象美等人,一起收錄和編纂了《孟云浦先生集》,因命副墨,用公同志。云浦著述其言詳略淺深不同,直證本心,為力行根柢,悉從文成良知,冥會推衍到此,洵由精以進于一者。集中藝文并勒,雖其一斑,亦皆意寄神行。凡慕云浦者,不獲睹其眉宇,儻手其遺編,以自淑艾,亦庶幾哉不至沉芬埋影,如所謂人琴而亡者。(張維新《刻孟云浦先生集序》)
云浦死后,馮從吾的洛學情懷并未少釋,繼續與云浦門人交往,相與論學。萬歷三十三年,云浦門人張抱初選授隴西知縣。因不避權貴,遂被誣貶為陜西按察司檢校官。他怡然赴任,與馮從吾聯袂講學關中書院,究身心性命之理,剖人禽善利、舜跖之分,折析如鑑,從吾遵其說,為圖付梓。萬歷四十三年,云浦高弟呂維祺有乙卯之役,會從吾先生于關中書院。萬歷四十七年,張抱初辭官賦閑,“隱居東山,筑闇修堂,訓迪多士,而秦晉汝穎間學者云集,乃創正學會所。環視門墻,弟子數千。先生猶以學而不講為憂,西與王惺所(以悟)先生會講于甘棠書院,東與呂豫石(維祺)先生聯會于川上書院。侍御李緝敬請先生主韶陽會。”(據從吾門人、河南總兵郭光復《理學張抱初先生傳》)馮從吾及其門人張太宇、孫繩祖等,先后多次過澠見張抱初,商學于正學會所。天啟改元,馮從吾高弟張春、郭光復復與孟云浦之子孟一誡、弟子張抱初、呂維祺,在澠池結真率會,建景運堂,日課后學。馮從吾及其弟子與云浦門人聯會講學,對豫西講會的復興,對洛學的發展,推波助浪,功不可沒。
天啟元年(1621)秋,馮從吾始應召赴京,擢左僉都御史,兩個月后任左副都御史。馮從吾到京后,與云浦摯友鄒元標、鐘文陸、高攀龍及門人李緝敬、曹真予數先生約會講學于城隍廟,“縉紳士庶環聽者,至廟院不能容。”天啟二年(1622)秋,又建首善書院于京城宣武門外。首善書院的講學活動再次轟動京師,前往聆聽者云集,興起者眾,足稱一時之盛。云浦高徒李緝敬將首善書院的講學語,匯輯成《都門語錄》。從吾先生在講學中,鼓勵士人以道自任,“一切事境不為撓屈”,挺起骨頭,在“內圣之學”中追求內在的超越。首善書院的轟動效應和馮從吾的疾惡如仇使閹黨集團如芒刺背,惶惶不安。閹黨兵部給事中朱童蒙上疏彈劾鄒元標與馮從吾,誣其清議朝政,“培植黨羽”。天啟二年(1622)九月,馮從吾上疏力辯,他在《疏》中說:“臣壯歲登朝,即與楊起元、孟化鯉、陶望齡輩立講學會,自臣告歸乃廢。京師講學,昔已有之,何至今日遂為詬厲?”(馮從吾.馮恭定全書:續集卷四)十月,馮從吾連上五疏,以夙病突發,日漸危急,不能供職為由,請告歸里。十一月,馮從吾由京歸陜,途經伊洛之間,見云浦學會復興,王惺所講于陜州、呂維祺講于新安、張抱初講于澠池,心里非常高興,“過其地,俱赴會大講。”(馮從吾.馮恭定全書:續集卷三)。
據《呂明德先生年譜》記載,天啟二年,時任驗封司郎中的呂維祺先生在新安休閑。時值朝野排擠正學,先生乃毅然以倡明斯道為己任,創七賢書院,祀“伊洛七賢”,同時,修復云浦講會,與云浦眾弟子大會于川上書院,與李緝敬、吳鹿友建“伊洛大社”,觀者達萬人以上。十二月,馮從吾途經新安,與呂維祺相晤,會講于云浦川上書院,呂維祺將此次會講的語錄輯為《川上會紀》。是日,微風披拂,天寒欲雪。與會者除馮從吾、呂維祺外,還有從吾先生之門人孫繩祖、楊道興及其子馮嘉年、其孫馮湛若,呂維祺舍弟呂吉孺、呂維袺同諸生數十余人在會。馮從吾曰:“人多言不踰矩,是我每如此便了,惟圣人則從心所欲。此言不是離卻從心所欲,便用檢點,便有不到處,便有踰時。”呂維祺先生曰:“我每亦是從心所欲不踰矩,只欠純耳。若不從心即皮膚上不踰,便假了。”吉孺、維袺問:“不遷怒,不貮過,便是學,抑其先有學乎?”馮少墟曰:“即此是學。”呂維祺曰:“‘‘二不’字,正是好學,離此安得另有學問?”會上還就“性相近習相遠”章及“致中和”等問題,作了深入探討。方夜篝燈團坐,諸生固問不已,問答數端,從吾先